Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCT5P48643 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCT5P48643 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCT5P48643 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCT5P48643 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCT5P48643 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCT5P48643 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCT5P48643 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCT5P48643 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCT5P48643 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCT5P48643 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT5P48643 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT5P48643 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT5P48643 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT5P48643 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT5P48643 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT5P48643 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT5P48643 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT5P48643 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT5P48643 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT5P48643 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT5P48643 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT5P48643 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT5P48643 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT5P48643 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT5P48643 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT5P48643 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT5P48643 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT5P48643 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT5P48643 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT5P48643 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT5P48643 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT5P48643 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT5P48643 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT5P48643 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT5P48643 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT5P48643 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT5P48643 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT5P48643 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT5P48643 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT5P48643 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT5P48643 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCT5P48643 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCT5P48643 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCT5P48643 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCT5P48643 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCT5P48643 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCT5P48643 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCT5P48643 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCT5P48643 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCT5P48643 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCT5P48643 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCT5P48643 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCT5P48643 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCT5P48643 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCT5P48643 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCT5P48643 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT5P48643 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT5P48643 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT5P48643 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT5P48643 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT5P48643 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT5P48643 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT5P48643 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT5P48643 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT5P48643 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCT5P48643 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCT5P48643 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCT5P48643 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCT5P48643 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCT5P48643 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCT5P48643 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCT5P48643 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCT5P48643 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCT5P48643 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCT5P48643 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCT5P48643 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCT5P48643 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCT5P48643 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCT5P48643 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCT5P48643 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCT5P48643 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCT5P48643 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCT5P48643 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCT5P48643 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCT5P48643 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCT5P48643 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCT5P48643 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCT5P48643 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCT5P48643 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCT5P48643 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCT5P48643 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCT5P48643 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCT5P48643 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCT5P48643 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCT5P48643 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCT5P48643 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCT5P48643 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCT5P48643 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCT5P48643 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms