Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ME1P48163 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ME1P48163 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ME1P48163 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ME1P48163 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ME1P48163 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ME1P48163 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ME1P48163 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ME1P48163 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ME1P48163 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ME1P48163 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME1P48163 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME1P48163 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME1P48163 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME1P48163 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ME1P48163 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ME1P48163 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ME1P48163 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME1P48163 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ME1P48163 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ME1P48163 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ME1P48163 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ME1P48163 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ME1P48163 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ME1P48163 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ME1P48163 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ME1P48163 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ME1P48163 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ME1P48163 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ME1P48163 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ME1P48163 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ME1P48163 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ME1P48163 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ME1P48163 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ME1P48163 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ME1P48163 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ME1P48163 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ME1P48163 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ME1P48163 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ME1P48163 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ME1P48163 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ME1P48163 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ME1P48163 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ME1P48163 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ME1P48163 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ME1P48163 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ME1P48163 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ME1P48163 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ME1P48163 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ME1P48163 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ME1P48163 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ME1P48163 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ME1P48163 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ME1P48163 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ME1P48163 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ME1P48163 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ME1P48163 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ME1P48163 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ME1P48163 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ME1P48163 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ME1P48163 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ME1P48163 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ME1P48163 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ME1P48163 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ME1P48163 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ME1P48163 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ME1P48163 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ME1P48163 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ME1P48163 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ME1P48163 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ME1P48163 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ME1P48163 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ME1P48163 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ME1P48163 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ME1P48163 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ME1P48163 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ME1P48163 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ME1P48163 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ME1P48163 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ME1P48163 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ME1P48163 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ME1P48163 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ME1P48163 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ME1P48163 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ME1P48163 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ME1P48163 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ME1P48163 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ME1P48163 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ME1P48163 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ME1P48163 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ME1P48163 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ME1P48163 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ME1P48163 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ME1P48163 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ME1P48163 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ME1P48163 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ME1P48163 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ME1P48163 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ME1P48163 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ME1P48163 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms