Protein–RNA interactions for Protein: P47712

PLA2G4A, Cytosolic phospholipase A2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4AP47712 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLA2G4AP47712 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G4AP47712 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLA2G4AP47712 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLA2G4AP47712 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLA2G4AP47712 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLA2G4AP47712 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G4AP47712 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G4AP47712 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G4AP47712 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G4AP47712 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G4AP47712 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G4AP47712 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G4AP47712 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms