Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCIP41743 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCIP41743 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCIP41743 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKCIP41743 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms