Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TXLNAP40222 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TXLNAP40222 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TXLNAP40222 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNAP40222 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNAP40222 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNAP40222 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNAP40222 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNAP40222 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNAP40222 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNAP40222 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNAP40222 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNAP40222 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNAP40222 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNAP40222 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNAP40222 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNAP40222 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNAP40222 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TXLNAP40222 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TXLNAP40222 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TXLNAP40222 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TXLNAP40222 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TXLNAP40222 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TXLNAP40222 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms