Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ITGAEP38570 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
ITGAEP38570 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
ITGAEP38570 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
ITGAEP38570 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
ITGAEP38570 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms