Protein–RNA interactions for Protein: P36776

LONP1, Lon protease homolog, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONP1P36776 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LONP1P36776 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LONP1P36776 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LONP1P36776 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LONP1P36776 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LONP1P36776 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LONP1P36776 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LONP1P36776 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LONP1P36776 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LONP1P36776 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LONP1P36776 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LONP1P36776 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONP1P36776 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONP1P36776 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONP1P36776 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONP1P36776 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONP1P36776 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONP1P36776 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONP1P36776 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONP1P36776 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONP1P36776 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONP1P36776 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONP1P36776 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONP1P36776 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONP1P36776 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONP1P36776 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONP1P36776 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONP1P36776 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONP1P36776 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONP1P36776 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONP1P36776 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONP1P36776 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LONP1P36776 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONP1P36776 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONP1P36776 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONP1P36776 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONP1P36776 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONP1P36776 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONP1P36776 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONP1P36776 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONP1P36776 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONP1P36776 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONP1P36776 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONP1P36776 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONP1P36776 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LONP1P36776 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONP1P36776 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONP1P36776 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONP1P36776 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONP1P36776 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LONP1P36776 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LONP1P36776 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LONP1P36776 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LONP1P36776 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LONP1P36776 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LONP1P36776 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONP1P36776 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONP1P36776 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONP1P36776 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONP1P36776 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONP1P36776 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONP1P36776 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONP1P36776 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LONP1P36776 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LONP1P36776 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LONP1P36776 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LONP1P36776 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LONP1P36776 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LONP1P36776 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LONP1P36776 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LONP1P36776 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LONP1P36776 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LONP1P36776 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LONP1P36776 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LONP1P36776 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LONP1P36776 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LONP1P36776 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LONP1P36776 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONP1P36776 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONP1P36776 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONP1P36776 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONP1P36776 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LONP1P36776 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LONP1P36776 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LONP1P36776 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LONP1P36776 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LONP1P36776 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LONP1P36776 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LONP1P36776 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LONP1P36776 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LONP1P36776 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LONP1P36776 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LONP1P36776 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LONP1P36776 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LONP1P36776 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LONP1P36776 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LONP1P36776 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LONP1P36776 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LONP1P36776 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LONP1P36776 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms