Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGCLP35914 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMGCLP35914 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGCLP35914 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms