Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP2P32456 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP2P32456 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP2P32456 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GBP2P32456 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP2P32456 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GBP2P32456 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP2P32456 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP2P32456 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GBP2P32456 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP2P32456 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP2P32456 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP2P32456 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GBP2P32456 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP2P32456 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP2P32456 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP2P32456 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GBP2P32456 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP2P32456 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP2P32456 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP2P32456 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP2P32456 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP2P32456 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP2P32456 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP2P32456 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP2P32456 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP2P32456 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP2P32456 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP2P32456 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP2P32456 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP2P32456 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP2P32456 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP2P32456 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP2P32456 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP2P32456 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP2P32456 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP2P32456 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP2P32456 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP2P32456 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP2P32456 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP2P32456 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP2P32456 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP2P32456 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP2P32456 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP2P32456 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP2P32456 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP2P32456 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP2P32456 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP2P32456 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP2P32456 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP2P32456 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP2P32456 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP2P32456 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP2P32456 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP2P32456 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP2P32456 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP2P32456 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP2P32456 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP2P32456 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP2P32456 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP2P32456 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP2P32456 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP2P32456 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP2P32456 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP2P32456 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP2P32456 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP2P32456 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP2P32456 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP2P32456 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GBP2P32456 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
GBP2P32456 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP2P32456 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP2P32456 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP2P32456 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP2P32456 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP2P32456 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP2P32456 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP2P32456 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP2P32456 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP2P32456 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP2P32456 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP2P32456 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP2P32456 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP2P32456 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP2P32456 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GBP2P32456 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP2P32456 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP2P32456 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP2P32456 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP2P32456 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP2P32456 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GBP2P32456 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP2P32456 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP2P32456 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP2P32456 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP2P32456 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GBP2P32456 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP2P32456 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP2P32456 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GBP2P32456 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms