Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC6A4P31645 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A4P31645 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A4P31645 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A4P31645 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms