Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP1P28562 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP1P28562 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms