Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB9P28065 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB9P28065 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB9P28065 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB9P28065 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms