Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A2P23975 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC6A2P23975 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A2P23975 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms