Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGFR4P22455 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGFR4P22455 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FGFR4P22455 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms