Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNA2P20248 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA2P20248 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNA2P20248 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNA2P20248 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms