Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRMP19623 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRMP19623 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRMP19623 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRMP19623 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRMP19623 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRMP19623 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRMP19623 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRMP19623 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRMP19623 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRMP19623 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRMP19623 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRMP19623 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRMP19623 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRMP19623 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRMP19623 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRMP19623 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRMP19623 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRMP19623 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRMP19623 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRMP19623 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRMP19623 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRMP19623 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRMP19623 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRMP19623 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRMP19623 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRMP19623 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRMP19623 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRMP19623 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRMP19623 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRMP19623 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRMP19623 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRMP19623 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRMP19623 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRMP19623 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRMP19623 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRMP19623 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRMP19623 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRMP19623 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRMP19623 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRMP19623 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRMP19623 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRMP19623 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRMP19623 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRMP19623 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRMP19623 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRMP19623 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRMP19623 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRMP19623 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRMP19623 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRMP19623 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRMP19623 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRMP19623 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRMP19623 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRMP19623 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRMP19623 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRMP19623 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRMP19623 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRMP19623 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRMP19623 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRMP19623 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRMP19623 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRMP19623 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRMP19623 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRMP19623 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRMP19623 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRMP19623 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRMP19623 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRMP19623 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SRMP19623 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRMP19623 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SRMP19623 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRMP19623 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRMP19623 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRMP19623 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRMP19623 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRMP19623 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRMP19623 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRMP19623 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRMP19623 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRMP19623 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRMP19623 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRMP19623 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRMP19623 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRMP19623 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRMP19623 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRMP19623 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRMP19623 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRMP19623 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRMP19623 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRMP19623 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SRMP19623 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRMP19623 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRMP19623 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRMP19623 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRMP19623 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRMP19623 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRMP19623 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRMP19623 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRMP19623 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms