Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCK1P16333 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCK1P16333 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCK1P16333 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCK1P16333 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCK1P16333 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCK1P16333 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCK1P16333 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCK1P16333 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCK1P16333 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCK1P16333 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCK1P16333 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCK1P16333 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCK1P16333 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCK1P16333 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCK1P16333 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCK1P16333 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCK1P16333 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCK1P16333 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NCK1P16333 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCK1P16333 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCK1P16333 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCK1P16333 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCK1P16333 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCK1P16333 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCK1P16333 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCK1P16333 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCK1P16333 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCK1P16333 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCK1P16333 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCK1P16333 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCK1P16333 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCK1P16333 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCK1P16333 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCK1P16333 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCK1P16333 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCK1P16333 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCK1P16333 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCK1P16333 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCK1P16333 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCK1P16333 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCK1P16333 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCK1P16333 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCK1P16333 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCK1P16333 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCK1P16333 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCK1P16333 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCK1P16333 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCK1P16333 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCK1P16333 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCK1P16333 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCK1P16333 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCK1P16333 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCK1P16333 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCK1P16333 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCK1P16333 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCK1P16333 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCK1P16333 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCK1P16333 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCK1P16333 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCK1P16333 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCK1P16333 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCK1P16333 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NCK1P16333 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NCK1P16333 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCK1P16333 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCK1P16333 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCK1P16333 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCK1P16333 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCK1P16333 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCK1P16333 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCK1P16333 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCK1P16333 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCK1P16333 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCK1P16333 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCK1P16333 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCK1P16333 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCK1P16333 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCK1P16333 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCK1P16333 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCK1P16333 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCK1P16333 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCK1P16333 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCK1P16333 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCK1P16333 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCK1P16333 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCK1P16333 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCK1P16333 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCK1P16333 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCK1P16333 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCK1P16333 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCK1P16333 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCK1P16333 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCK1P16333 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NCK1P16333 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCK1P16333 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCK1P16333 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCK1P16333 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCK1P16333 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCK1P16333 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms