Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMP2P13473 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMP2P13473 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMP2P13473 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms