Protein–RNA interactions for Protein: P12259

F5, Coagulation factor V, humanhuman

Predictions only

Length 2,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5P12259 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
F5P12259 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
F5P12259 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
F5P12259 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
F5P12259 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
F5P12259 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
F5P12259 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
F5P12259 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
F5P12259 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
F5P12259 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
F5P12259 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
F5P12259 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
F5P12259 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
F5P12259 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
F5P12259 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
F5P12259 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
F5P12259 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F5P12259 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F5P12259 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
F5P12259 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F5P12259 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
F5P12259 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
F5P12259 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
F5P12259 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F5P12259 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
F5P12259 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F5P12259 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F5P12259 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F5P12259 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F5P12259 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F5P12259 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F5P12259 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F5P12259 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
F5P12259 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
F5P12259 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
F5P12259 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
F5P12259 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
F5P12259 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F5P12259 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
F5P12259 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
F5P12259 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
F5P12259 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F5P12259 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F5P12259 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F5P12259 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F5P12259 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F5P12259 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F5P12259 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F5P12259 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
F5P12259 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F5P12259 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F5P12259 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F5P12259 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F5P12259 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F5P12259 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F5P12259 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
F5P12259 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F5P12259 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F5P12259 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
F5P12259 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
F5P12259 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
F5P12259 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
F5P12259 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
F5P12259 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
F5P12259 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
F5P12259 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
F5P12259 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F5P12259 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F5P12259 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
F5P12259 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
F5P12259 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F5P12259 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5P12259 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5P12259 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5P12259 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5P12259 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5P12259 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5P12259 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5P12259 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5P12259 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
F5P12259 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5P12259 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F5P12259 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F5P12259 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5P12259 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5P12259 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5P12259 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5P12259 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5P12259 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5P12259 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5P12259 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5P12259 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5P12259 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5P12259 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5P12259 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5P12259 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
F5P12259 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
F5P12259 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F5P12259 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
F5P12259 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms