Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNAP12004 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNAP12004 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNAP12004 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNAP12004 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNAP12004 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNAP12004 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNAP12004 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNAP12004 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNAP12004 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNAP12004 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNAP12004 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNAP12004 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNAP12004 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNAP12004 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNAP12004 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNAP12004 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNAP12004 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNAP12004 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNAP12004 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNAP12004 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNAP12004 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNAP12004 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNAP12004 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNAP12004 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNAP12004 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNAP12004 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNAP12004 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNAP12004 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNAP12004 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNAP12004 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNAP12004 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNAP12004 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNAP12004 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNAP12004 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNAP12004 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNAP12004 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNAP12004 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNAP12004 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNAP12004 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNAP12004 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNAP12004 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNAP12004 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNAP12004 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNAP12004 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNAP12004 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNAP12004 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNAP12004 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNAP12004 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNAP12004 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNAP12004 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNAP12004 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNAP12004 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNAP12004 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNAP12004 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNAP12004 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNAP12004 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNAP12004 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNAP12004 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNAP12004 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNAP12004 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNAP12004 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNAP12004 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNAP12004 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNAP12004 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNAP12004 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNAP12004 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNAP12004 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNAP12004 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNAP12004 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNAP12004 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNAP12004 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNAP12004 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNAP12004 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNAP12004 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNAP12004 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNAP12004 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNAP12004 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNAP12004 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNAP12004 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNAP12004 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNAP12004 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNAP12004 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNAP12004 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNAP12004 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNAP12004 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNAP12004 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNAP12004 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNAP12004 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNAP12004 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNAP12004 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNAP12004 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNAP12004 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNAP12004 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNAP12004 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNAP12004 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNAP12004 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNAP12004 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNAP12004 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNAP12004 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms