Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM225BP0DP42 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM225BP0DP42 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM225BP0DP42 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms