Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALM3P0DP25 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CALM3P0DP25 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CALM3P0DP25 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms