Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMIM13P0DJ93 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM13P0DJ93 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms