Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC159P0C7I6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC159P0C7I6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC159P0C7I6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms