Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VIL1P09327 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VIL1P09327 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VIL1P09327 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VIL1P09327 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VIL1P09327 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
VIL1P09327 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VIL1P09327 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VIL1P09327 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VIL1P09327 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VIL1P09327 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VIL1P09327 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VIL1P09327 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VIL1P09327 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VIL1P09327 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VIL1P09327 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VIL1P09327 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VIL1P09327 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VIL1P09327 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
VIL1P09327 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
VIL1P09327 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
VIL1P09327 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VIL1P09327 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VIL1P09327 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VIL1P09327 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VIL1P09327 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VIL1P09327 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VIL1P09327 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VIL1P09327 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VIL1P09327 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VIL1P09327 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VIL1P09327 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VIL1P09327 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VIL1P09327 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VIL1P09327 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VIL1P09327 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VIL1P09327 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VIL1P09327 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VIL1P09327 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VIL1P09327 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VIL1P09327 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VIL1P09327 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VIL1P09327 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VIL1P09327 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VIL1P09327 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
VIL1P09327 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VIL1P09327 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VIL1P09327 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VIL1P09327 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VIL1P09327 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VIL1P09327 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
VIL1P09327 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
VIL1P09327 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VIL1P09327 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VIL1P09327 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VIL1P09327 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VIL1P09327 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VIL1P09327 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
VIL1P09327 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VIL1P09327 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VIL1P09327 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VIL1P09327 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VIL1P09327 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VIL1P09327 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VIL1P09327 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VIL1P09327 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VIL1P09327 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VIL1P09327 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VIL1P09327 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VIL1P09327 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VIL1P09327 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VIL1P09327 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VIL1P09327 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
VIL1P09327 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VIL1P09327 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VIL1P09327 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
VIL1P09327 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VIL1P09327 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VIL1P09327 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VIL1P09327 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VIL1P09327 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
VIL1P09327 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VIL1P09327 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VIL1P09327 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VIL1P09327 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VIL1P09327 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VIL1P09327 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VIL1P09327 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VIL1P09327 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VIL1P09327 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VIL1P09327 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VIL1P09327 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VIL1P09327 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VIL1P09327 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VIL1P09327 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VIL1P09327 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VIL1P09327 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VIL1P09327 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
VIL1P09327 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
VIL1P09327 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms