Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD48P09326 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD48P09326 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD48P09326 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD48P09326 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD48P09326 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD48P09326 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD48P09326 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD48P09326 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD48P09326 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD48P09326 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD48P09326 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD48P09326 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD48P09326 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD48P09326 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD48P09326 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD48P09326 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD48P09326 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD48P09326 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD48P09326 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD48P09326 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD48P09326 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD48P09326 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CD48P09326 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD48P09326 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD48P09326 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD48P09326 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD48P09326 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD48P09326 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD48P09326 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD48P09326 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD48P09326 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD48P09326 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD48P09326 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD48P09326 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CD48P09326 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD48P09326 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD48P09326 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD48P09326 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD48P09326 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD48P09326 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CD48P09326 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD48P09326 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CD48P09326 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD48P09326 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD48P09326 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD48P09326 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD48P09326 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD48P09326 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD48P09326 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD48P09326 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD48P09326 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD48P09326 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD48P09326 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD48P09326 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD48P09326 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD48P09326 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD48P09326 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD48P09326 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD48P09326 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD48P09326 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CD48P09326 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CD48P09326 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CD48P09326 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD48P09326 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD48P09326 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD48P09326 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD48P09326 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD48P09326 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD48P09326 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD48P09326 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD48P09326 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD48P09326 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD48P09326 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD48P09326 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CD48P09326 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD48P09326 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD48P09326 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD48P09326 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD48P09326 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD48P09326 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD48P09326 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD48P09326 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD48P09326 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD48P09326 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD48P09326 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD48P09326 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD48P09326 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD48P09326 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD48P09326 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD48P09326 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD48P09326 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD48P09326 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD48P09326 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD48P09326 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CD48P09326 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD48P09326 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD48P09326 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD48P09326 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD48P09326 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms