Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MMP3P08254 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MMP3P08254 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MMP3P08254 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MMP3P08254 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MMP3P08254 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MMP3P08254 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MMP3P08254 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MMP3P08254 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MMP3P08254 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MMP3P08254 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MMP3P08254 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP3P08254 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MMP3P08254 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP3P08254 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MMP3P08254 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP3P08254 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMP3P08254 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MMP3P08254 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMP3P08254 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MMP3P08254 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMP3P08254 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MMP3P08254 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP3P08254 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP3P08254 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP3P08254 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP3P08254 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP3P08254 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MMP3P08254 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP3P08254 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMP3P08254 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP3P08254 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP3P08254 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MMP3P08254 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP3P08254 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP3P08254 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MMP3P08254 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP3P08254 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP3P08254 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP3P08254 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP3P08254 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP3P08254 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP3P08254 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP3P08254 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP3P08254 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP3P08254 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP3P08254 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP3P08254 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP3P08254 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP3P08254 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP3P08254 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP3P08254 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP3P08254 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP3P08254 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP3P08254 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP3P08254 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP3P08254 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP3P08254 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP3P08254 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP3P08254 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP3P08254 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP3P08254 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP3P08254 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP3P08254 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP3P08254 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP3P08254 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP3P08254 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP3P08254 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP3P08254 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMP3P08254 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMP3P08254 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP3P08254 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP3P08254 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP3P08254 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP3P08254 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP3P08254 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP3P08254 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP3P08254 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP3P08254 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP3P08254 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP3P08254 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP3P08254 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP3P08254 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP3P08254 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP3P08254 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP3P08254 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP3P08254 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP3P08254 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP3P08254 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP3P08254 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP3P08254 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP3P08254 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP3P08254 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP3P08254 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP3P08254 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP3P08254 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP3P08254 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP3P08254 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP3P08254 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MMP3P08254 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms