Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAVP06756 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAVP06756 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms