Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB4AP04350 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TUBB4AP04350 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBB4AP04350 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB4AP04350 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms