Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRNPP04156 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRNPP04156 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRNPP04156 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRNPP04156 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRNPP04156 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRNPP04156 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRNPP04156 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRNPP04156 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRNPP04156 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRNPP04156 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRNPP04156 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRNPP04156 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRNPP04156 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRNPP04156 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRNPP04156 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRNPP04156 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRNPP04156 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRNPP04156 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRNPP04156 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRNPP04156 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRNPP04156 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRNPP04156 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRNPP04156 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRNPP04156 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRNPP04156 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRNPP04156 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRNPP04156 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRNPP04156 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRNPP04156 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRNPP04156 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRNPP04156 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRNPP04156 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRNPP04156 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRNPP04156 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRNPP04156 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRNPP04156 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRNPP04156 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRNPP04156 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRNPP04156 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRNPP04156 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRNPP04156 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRNPP04156 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRNPP04156 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRNPP04156 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRNPP04156 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRNPP04156 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRNPP04156 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRNPP04156 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRNPP04156 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRNPP04156 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRNPP04156 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRNPP04156 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRNPP04156 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRNPP04156 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRNPP04156 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRNPP04156 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRNPP04156 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRNPP04156 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRNPP04156 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRNPP04156 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRNPP04156 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRNPP04156 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRNPP04156 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRNPP04156 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRNPP04156 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRNPP04156 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRNPP04156 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRNPP04156 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRNPP04156 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRNPP04156 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRNPP04156 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRNPP04156 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRNPP04156 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRNPP04156 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRNPP04156 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRNPP04156 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRNPP04156 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRNPP04156 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRNPP04156 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRNPP04156 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRNPP04156 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRNPP04156 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRNPP04156 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRNPP04156 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRNPP04156 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRNPP04156 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRNPP04156 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRNPP04156 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRNPP04156 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRNPP04156 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRNPP04156 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRNPP04156 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRNPP04156 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRNPP04156 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRNPP04156 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRNPP04156 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRNPP04156 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRNPP04156 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRNPP04156 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms