Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMC2O95347 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMC2O95347 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMC2O95347 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC2O95347 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMC2O95347 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMC2O95347 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMC2O95347 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMC2O95347 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMC2O95347 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SMC2O95347 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SMC2O95347 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC2O95347 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC2O95347 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC2O95347 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC2O95347 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC2O95347 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC2O95347 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC2O95347 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC2O95347 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC2O95347 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC2O95347 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC2O95347 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC2O95347 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMC2O95347 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC2O95347 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC2O95347 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC2O95347 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC2O95347 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC2O95347 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC2O95347 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC2O95347 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC2O95347 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC2O95347 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC2O95347 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC2O95347 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC2O95347 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC2O95347 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC2O95347 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC2O95347 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC2O95347 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC2O95347 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC2O95347 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC2O95347 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC2O95347 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC2O95347 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC2O95347 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC2O95347 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC2O95347 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC2O95347 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC2O95347 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC2O95347 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC2O95347 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC2O95347 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC2O95347 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC2O95347 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC2O95347 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC2O95347 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC2O95347 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC2O95347 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC2O95347 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC2O95347 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC2O95347 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMC2O95347 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMC2O95347 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMC2O95347 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC2O95347 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC2O95347 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC2O95347 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC2O95347 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC2O95347 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC2O95347 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC2O95347 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC2O95347 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC2O95347 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC2O95347 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC2O95347 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC2O95347 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC2O95347 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC2O95347 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC2O95347 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC2O95347 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC2O95347 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC2O95347 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC2O95347 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC2O95347 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC2O95347 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC2O95347 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMC2O95347 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC2O95347 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC2O95347 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC2O95347 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC2O95347 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC2O95347 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC2O95347 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC2O95347 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC2O95347 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC2O95347 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC2O95347 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC2O95347 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms