Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEBLO76041 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEBLO76041 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEBLO76041 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEBLO76041 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEBLO76041 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEBLO76041 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEBLO76041 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEBLO76041 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEBLO76041 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEBLO76041 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEBLO76041 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEBLO76041 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEBLO76041 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEBLO76041 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEBLO76041 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEBLO76041 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEBLO76041 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEBLO76041 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEBLO76041 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEBLO76041 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEBLO76041 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEBLO76041 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEBLO76041 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEBLO76041 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEBLO76041 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEBLO76041 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEBLO76041 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEBLO76041 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEBLO76041 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEBLO76041 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEBLO76041 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEBLO76041 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEBLO76041 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEBLO76041 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEBLO76041 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEBLO76041 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEBLO76041 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEBLO76041 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEBLO76041 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEBLO76041 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEBLO76041 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEBLO76041 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEBLO76041 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEBLO76041 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEBLO76041 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEBLO76041 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEBLO76041 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEBLO76041 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEBLO76041 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEBLO76041 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEBLO76041 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEBLO76041 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEBLO76041 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEBLO76041 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEBLO76041 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEBLO76041 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEBLO76041 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEBLO76041 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEBLO76041 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEBLO76041 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEBLO76041 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEBLO76041 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEBLO76041 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEBLO76041 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEBLO76041 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEBLO76041 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEBLO76041 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEBLO76041 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEBLO76041 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEBLO76041 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEBLO76041 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEBLO76041 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEBLO76041 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEBLO76041 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEBLO76041 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEBLO76041 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEBLO76041 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEBLO76041 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEBLO76041 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEBLO76041 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEBLO76041 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEBLO76041 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEBLO76041 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEBLO76041 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms