Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNSO60931 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNSO60931 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNSO60931 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTNSO60931 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNSO60931 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNSO60931 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTNSO60931 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNSO60931 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNSO60931 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNSO60931 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNSO60931 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNSO60931 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTNSO60931 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNSO60931 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNSO60931 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNSO60931 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNSO60931 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNSO60931 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNSO60931 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNSO60931 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTNSO60931 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNSO60931 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNSO60931 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNSO60931 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNSO60931 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNSO60931 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNSO60931 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNSO60931 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNSO60931 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNSO60931 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNSO60931 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNSO60931 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNSO60931 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNSO60931 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNSO60931 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNSO60931 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNSO60931 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNSO60931 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNSO60931 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNSO60931 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNSO60931 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNSO60931 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNSO60931 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNSO60931 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNSO60931 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNSO60931 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNSO60931 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNSO60931 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNSO60931 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNSO60931 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNSO60931 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNSO60931 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNSO60931 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNSO60931 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNSO60931 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNSO60931 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNSO60931 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNSO60931 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNSO60931 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNSO60931 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNSO60931 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNSO60931 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNSO60931 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNSO60931 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNSO60931 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNSO60931 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNSO60931 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNSO60931 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNSO60931 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNSO60931 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNSO60931 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNSO60931 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNSO60931 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNSO60931 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNSO60931 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNSO60931 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNSO60931 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNSO60931 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNSO60931 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNSO60931 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNSO60931 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNSO60931 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNSO60931 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNSO60931 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNSO60931 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNSO60931 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNSO60931 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNSO60931 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNSO60931 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNSO60931 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNSO60931 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNSO60931 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNSO60931 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNSO60931 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNSO60931 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNSO60931 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNSO60931 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNSO60931 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNSO60931 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms