Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF13O43567 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF13O43567 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF13O43567 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF13O43567 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF13O43567 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF13O43567 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF13O43567 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF13O43567 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF13O43567 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF13O43567 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF13O43567 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF13O43567 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF13O43567 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF13O43567 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF13O43567 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF13O43567 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF13O43567 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF13O43567 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF13O43567 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF13O43567 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF13O43567 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF13O43567 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF13O43567 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF13O43567 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF13O43567 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF13O43567 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF13O43567 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF13O43567 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF13O43567 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF13O43567 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF13O43567 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF13O43567 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF13O43567 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF13O43567 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF13O43567 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF13O43567 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF13O43567 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF13O43567 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF13O43567 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF13O43567 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF13O43567 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF13O43567 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF13O43567 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF13O43567 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF13O43567 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF13O43567 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF13O43567 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF13O43567 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF13O43567 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF13O43567 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF13O43567 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF13O43567 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF13O43567 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF13O43567 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF13O43567 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF13O43567 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF13O43567 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF13O43567 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF13O43567 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF13O43567 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF13O43567 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF13O43567 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF13O43567 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF13O43567 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF13O43567 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF13O43567 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF13O43567 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF13O43567 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF13O43567 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF13O43567 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF13O43567 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF13O43567 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF13O43567 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF13O43567 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF13O43567 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF13O43567 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF13O43567 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF13O43567 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF13O43567 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF13O43567 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF13O43567 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF13O43567 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF13O43567 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF13O43567 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF13O43567 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF13O43567 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF13O43567 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF13O43567 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF13O43567 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF13O43567 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF13O43567 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF13O43567 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF13O43567 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF13O43567 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF13O43567 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF13O43567 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF13O43567 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF13O43567 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF13O43567 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms