Protein–RNA interactions for Protein: O43257

ZNHIT1, Zinc finger HIT domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT1O43257 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNHIT1O43257 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNHIT1O43257 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNHIT1O43257 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNHIT1O43257 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNHIT1O43257 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT1O43257 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT1O43257 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT1O43257 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT1O43257 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT1O43257 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT1O43257 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT1O43257 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT1O43257 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNHIT1O43257 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNHIT1O43257 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.7 ms