Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A1O15245 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms