Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PFDN6O15212 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PFDN6O15212 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PFDN6O15212 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFDN6O15212 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms