Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CITO14578 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CITO14578 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CITO14578 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CITO14578 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CITO14578 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CITO14578 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CITO14578 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CITO14578 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CITO14578 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CITO14578 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CITO14578 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CITO14578 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CITO14578 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CITO14578 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CITO14578 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CITO14578 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CITO14578 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CITO14578 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CITO14578 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CITO14578 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CITO14578 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CITO14578 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CITO14578 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CITO14578 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CITO14578 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CITO14578 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CITO14578 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CITO14578 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CITO14578 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CITO14578 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CITO14578 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CITO14578 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CITO14578 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CITO14578 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CITO14578 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CITO14578 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CITO14578 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CITO14578 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CITO14578 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CITO14578 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CITO14578 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CITO14578 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CITO14578 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CITO14578 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CITO14578 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CITO14578 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CITO14578 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CITO14578 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CITO14578 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CITO14578 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CITO14578 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CITO14578 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CITO14578 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CITO14578 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CITO14578 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CITO14578 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CITO14578 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CITO14578 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CITO14578 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CITO14578 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CITO14578 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CITO14578 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CITO14578 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CITO14578 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CITO14578 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CITO14578 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CITO14578 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CITO14578 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CITO14578 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CITO14578 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CITO14578 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CITO14578 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CITO14578 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CITO14578 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CITO14578 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CITO14578 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CITO14578 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CITO14578 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CITO14578 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CITO14578 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CITO14578 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CITO14578 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CITO14578 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CITO14578 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CITO14578 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CITO14578 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CITO14578 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CITO14578 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CITO14578 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CITO14578 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CITO14578 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CITO14578 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CITO14578 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CITO14578 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CITO14578 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CITO14578 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CITO14578 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CITO14578 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CITO14578 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms