Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3KRW8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3KRW8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3KRW8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3KRW8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3KRW8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3KRW8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3KRW8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3KRW8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
J3KRW8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
J3KRW8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
J3KRW8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3KRW8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3KRW8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3KRW8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
J3KRW8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3KRW8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3KRW8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3KRW8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3KRW8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3KRW8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3KRW8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3KRW8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3KRW8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3KRW8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3KRW8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
J3KRW8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3KRW8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3KRW8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3KRW8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3KRW8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3KRW8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3KRW8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3KRW8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3KRW8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3KRW8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3KRW8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3KRW8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3KRW8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3KRW8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3KRW8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3KRW8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3KRW8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3KRW8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3KRW8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3KRW8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
J3KRW8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3KRW8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3KRW8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3KRW8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3KRW8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3KRW8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3KRW8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3KRW8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3KRW8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
J3KRW8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3KRW8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3KRW8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3KRW8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3KRW8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3KRW8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3KRW8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3KRW8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
J3KRW8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
J3KRW8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3KRW8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3KRW8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3KRW8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3KRW8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3KRW8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3KRW8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3KRW8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3KRW8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3KRW8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3KRW8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3KRW8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
J3KRW8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
J3KRW8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3KRW8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
J3KRW8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3KRW8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3KRW8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3KRW8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
J3KRW8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
J3KRW8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
J3KRW8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
J3KRW8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
J3KRW8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
J3KRW8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
J3KRW8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
J3KRW8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
J3KRW8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3KRW8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3KRW8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3KRW8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3KRW8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
J3KRW8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3KRW8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3KRW8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3KRW8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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