Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H7C0S8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
H7C0S8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H7C0S8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H7C0S8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H7C0S8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H7C0S8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H7C0S8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H7C0S8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H7C0S8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H7C0S8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H7C0S8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H7C0S8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H7C0S8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H7C0S8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H7C0S8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H7C0S8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H7C0S8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H7C0S8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
H7C0S8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H7C0S8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
H7C0S8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H7C0S8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H7C0S8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H7C0S8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H7C0S8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H7C0S8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H7C0S8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H7C0S8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H7C0S8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H7C0S8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H7C0S8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
H7C0S8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C0S8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C0S8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C0S8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C0S8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C0S8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C0S8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C0S8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C0S8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C0S8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C0S8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C0S8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C0S8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C0S8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C0S8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C0S8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C0S8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C0S8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C0S8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C0S8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C0S8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C0S8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C0S8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C0S8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C0S8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C0S8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C0S8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H7C0S8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H7C0S8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H7C0S8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H7C0S8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
H7C0S8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H7C0S8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H7C0S8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C0S8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H7C0S8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H7C0S8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H7C0S8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H7C0S8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C0S8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C0S8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C0S8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C0S8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C0S8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C0S8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C0S8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C0S8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C0S8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C0S8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C0S8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C0S8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C0S8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C0S8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C0S8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C0S8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C0S8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C0S8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C0S8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C0S8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C0S8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C0S8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C0S8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C0S8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C0S8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C0S8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C0S8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C0S8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C0S8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms