Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
H3BQV1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
H3BQV1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
H3BQV1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H3BQV1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H3BQV1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H3BQV1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
H3BQV1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
H3BQV1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
H3BQV1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
H3BQV1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
H3BQV1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
H3BQV1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
H3BQV1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
H3BQV1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
H3BQV1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
H3BQV1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
H3BQV1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
H3BQV1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
H3BQV1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
H3BQV1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
H3BQV1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
H3BQV1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
H3BQV1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
H3BQV1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
H3BQV1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
H3BQV1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
H3BQV1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
H3BQV1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
H3BQV1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
H3BQV1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
H3BQV1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
H3BQV1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
H3BQV1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H3BQV1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
H3BQV1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H3BQV1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H3BQV1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H3BQV1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H3BQV1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H3BQV1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H3BQV1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H3BQV1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H3BQV1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H3BQV1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
H3BQV1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
H3BQV1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
H3BQV1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
H3BQV1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
H3BQV1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
H3BQV1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
H3BQV1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
H3BQV1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
H3BQV1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
H3BQV1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
H3BQV1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
H3BQV1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
H3BQV1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
H3BQV1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
H3BQV1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
H3BQV1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
H3BQV1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
H3BQV1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
H3BQV1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
H3BQV1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
H3BQV1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
H3BQV1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
H3BQV1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
H3BQV1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
H3BQV1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
H3BQV1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
H3BQV1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H3BQV1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
H3BQV1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
H3BQV1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
H3BQV1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
H3BQV1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
H3BQV1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
H3BQV1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
H3BQV1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
H3BQV1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
H3BQV1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
H3BQV1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
H3BQV1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
H3BQV1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
H3BQV1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
H3BQV1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
H3BQV1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
H3BQV1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
H3BQV1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
H3BQV1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
H3BQV1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
H3BQV1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
H3BQV1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
H3BQV1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
H3BQV1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
H3BQV1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
H3BQV1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
H3BQV1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
H3BQV1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms