Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCRIP1C9JLW8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCRIP1C9JLW8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCRIP1C9JLW8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MCRIP1C9JLW8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCRIP1C9JLW8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCRIP1C9JLW8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCRIP1C9JLW8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MCRIP1C9JLW8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCRIP1C9JLW8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCRIP1C9JLW8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCRIP1C9JLW8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCRIP1C9JLW8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MCRIP1C9JLW8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MCRIP1C9JLW8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MCRIP1C9JLW8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MCRIP1C9JLW8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MCRIP1C9JLW8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MCRIP1C9JLW8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MCRIP1C9JLW8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MCRIP1C9JLW8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MCRIP1C9JLW8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms