Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L5A8MUK1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP17L5A8MUK1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP17L5A8MUK1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L5A8MUK1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms