Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWA3AA6NCI4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
VWA3AA6NCI4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
VWA3AA6NCI4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VWA3AA6NCI4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms