Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.128e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.111e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-215ENST00000476384 936 ntTSL 515.72■□□□□ 0.118e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.15e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SRRT-201ENST00000423692 727 ntTSL 515.7■□□□□ 0.11e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-228ENST00000560975 2855 ntTSL 515.7■□□□□ 0.15e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TAF1D-211ENST00000529508 538 ntTSL 215.66■□□□□ 0.18e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TAF1D-220ENST00000534770 737 ntTSL 315.66■□□□□ 0.18e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ANO9-206ENST00000528927 2639 ntTSL 1 (best)15.58■□□□□ 0.088e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STRN4-207ENST00000594357 850 ntTSL 515.57■□□□□ 0.081e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.078e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NCOR2-216ENST00000461081 2910 ntTSL 215.52■□□□□ 0.078e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NCOR2-211ENST00000443451 951 ntTSL 515.48■□□□□ 0.078e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CREBZF-205ENST00000527529 898 ntTSL 515.46■□□□□ 0.078e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 GOLGA4-203ENST00000419177 760 ntTSL 315.45■□□□□ 0.065e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MPP1-218ENST00000494170 969 ntTSL 315.43■□□□□ 0.068e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STRN4-221ENST00000601631 1125 ntTSL 215.39■□□□□ 0.051e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.058e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NPRL3-213ENST00000621703 2812 ntTSL 1 (best)15.38■□□□□ 0.058e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.053e-10■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.058e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CREBZF-208ENST00000531515 724 ntTSL 315.31■□□□□ 0.048e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.045e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NPRL3-214ENST00000622194 2981 ntTSL 515.28■□□□□ 0.048e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NOL7-201ENST00000420088 646 ntTSL 215.24■□□□□ 0.039e-15■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.015e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-216ENST00000483434 874 ntTSL 315.14■□□□□ 0.018e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-218ENST00000523460 572 ntTSL 415.12■□□□□ 0.018e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.018e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MPP1-212ENST00000475943 860 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ -08e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-206ENST00000436445 752 ntTSL 214.98□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-208ENST00000445961 944 ntTSL 514.98□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SRPK2-206ENST00000465112 568 ntTSL 314.98□□□□□ -0.018e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.025e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MPP1-207ENST00000428488 581 ntTSL 314.88□□□□□ -0.038e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MPP1-209ENST00000453245 729 ntTSL 514.88□□□□□ -0.038e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.031e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 QARS-214ENST00000478561 670 ntTSL 314.79□□□□□ -0.048e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STRN4-206ENST00000594287 951 ntTSL 514.67□□□□□ -0.061e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.065e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-209ENST00000448962 2384 ntTSL 214.58□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AP2A1-206ENST00000600199 2381 ntTSL 514.54□□□□□ -0.085e-7■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SCARB1-207ENST00000541661 476 ntTSL 514.45□□□□□ -0.13e-10■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-211ENST00000484121 897 ntTSL 214.42□□□□□ -0.11e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 GOLGA4-205ENST00000431105 568 ntTSL 314.41□□□□□ -0.15e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SRPK2-203ENST00000460391 666 ntTSL 214.39□□□□□ -0.118e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.128e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.125e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-217ENST00000582022 2409 ntTSL 1 (best)14.26□□□□□ -0.138e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-207ENST00000578756 652 ntTSL 214.22□□□□□ -0.138e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.151e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.158e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.151e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-206ENST00000518601 905 ntTSL 514.04□□□□□ -0.168e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-230ENST00000561266 671 ntTSL 313.99□□□□□ -0.175e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.188e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 USP20-205ENST00000474895 825 ntTSL 513.9□□□□□ -0.188e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.191e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.198e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 GNAS-236ENST00000479025 466 ntTSL 213.81□□□□□ -0.29e-15■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.228e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.248e-6■□□□□ 8.1
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PUM1Q14671 CREBZF-202ENST00000490820 4329 ntTSL 1 (best)13.5□□□□□ -0.258e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-220ENST00000583329 998 ntTSL 313.43□□□□□ -0.268e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.268e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.288e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.288e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TAF1D-201ENST00000323981 2540 ntTSL 213.16□□□□□ -0.38e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-213ENST00000467096 942 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.318e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.328e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MAP7D1-206ENST00000462118 776 ntTSL 312.92□□□□□ -0.348e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STRN4-223ENST00000602223 554 ntTSL 412.92□□□□□ -0.341e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AUP1-208ENST00000486234 984 ntTSL 512.87□□□□□ -0.358e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.351e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.358e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-219ENST00000496003 815 ntTSL 512.84□□□□□ -0.358e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-215ENST00000558868 653 ntTSL 212.84□□□□□ -0.355e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.378e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SRPK2-204ENST00000462282 505 ntTSL 312.72□□□□□ -0.378e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.388e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CASC4-205ENST00000558735 427 ntTSL 312.68□□□□□ -0.388e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NPRL3-210ENST00000610509 2917 ntTSL 212.68□□□□□ -0.388e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.398e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.48e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-212ENST00000495002 956 ntTSL 1 (best)12.52□□□□□ -0.411e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.418e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.418e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-220ENST00000496117 528 ntTSL 512.46□□□□□ -0.418e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MPP1-210ENST00000462825 587 ntTSL 412.42□□□□□ -0.428e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 BNIP3L-203ENST00000520077 922 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.451e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 HSPD1-205ENST00000428204 549 ntTSL 412.17□□□□□ -0.461e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-214ENST00000580601 2786 ntTSL 211.96□□□□□ -0.498e-6■□□□□ 8.1
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