Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.128e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.111e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-215ENST00000476384 936 ntTSL 515.72■□□□□ 0.118e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.15e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SRRT-201ENST00000423692 727 ntTSL 515.7■□□□□ 0.11e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-228ENST00000560975 2855 ntTSL 515.7■□□□□ 0.15e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TAF1D-211ENST00000529508 538 ntTSL 215.66■□□□□ 0.18e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TAF1D-220ENST00000534770 737 ntTSL 315.66■□□□□ 0.18e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ANO9-206ENST00000528927 2639 ntTSL 1 (best)15.58■□□□□ 0.088e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STRN4-207ENST00000594357 850 ntTSL 515.57■□□□□ 0.081e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.078e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NCOR2-216ENST00000461081 2910 ntTSL 215.52■□□□□ 0.078e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NCOR2-211ENST00000443451 951 ntTSL 515.48■□□□□ 0.078e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CREBZF-205ENST00000527529 898 ntTSL 515.46■□□□□ 0.078e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 GOLGA4-203ENST00000419177 760 ntTSL 315.45■□□□□ 0.065e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MPP1-218ENST00000494170 969 ntTSL 315.43■□□□□ 0.068e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STRN4-221ENST00000601631 1125 ntTSL 215.39■□□□□ 0.051e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.058e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NPRL3-213ENST00000621703 2812 ntTSL 1 (best)15.38■□□□□ 0.058e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.053e-10■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.058e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CREBZF-208ENST00000531515 724 ntTSL 315.31■□□□□ 0.048e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.045e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NPRL3-214ENST00000622194 2981 ntTSL 515.28■□□□□ 0.048e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NOL7-201ENST00000420088 646 ntTSL 215.24■□□□□ 0.039e-15■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.015e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-216ENST00000483434 874 ntTSL 315.14■□□□□ 0.018e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-218ENST00000523460 572 ntTSL 415.12■□□□□ 0.018e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.018e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MPP1-212ENST00000475943 860 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ -08e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-206ENST00000436445 752 ntTSL 214.98□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-208ENST00000445961 944 ntTSL 514.98□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SRPK2-206ENST00000465112 568 ntTSL 314.98□□□□□ -0.018e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.025e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MPP1-207ENST00000428488 581 ntTSL 314.88□□□□□ -0.038e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MPP1-209ENST00000453245 729 ntTSL 514.88□□□□□ -0.038e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.031e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 QARS-214ENST00000478561 670 ntTSL 314.79□□□□□ -0.048e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STRN4-206ENST00000594287 951 ntTSL 514.67□□□□□ -0.061e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.065e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-209ENST00000448962 2384 ntTSL 214.58□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AP2A1-206ENST00000600199 2381 ntTSL 514.54□□□□□ -0.085e-7■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SCARB1-207ENST00000541661 476 ntTSL 514.45□□□□□ -0.13e-10■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-211ENST00000484121 897 ntTSL 214.42□□□□□ -0.11e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 GOLGA4-205ENST00000431105 568 ntTSL 314.41□□□□□ -0.15e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SRPK2-203ENST00000460391 666 ntTSL 214.39□□□□□ -0.118e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.128e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.125e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-217ENST00000582022 2409 ntTSL 1 (best)14.26□□□□□ -0.138e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-207ENST00000578756 652 ntTSL 214.22□□□□□ -0.138e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.151e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.158e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.151e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-206ENST00000518601 905 ntTSL 514.04□□□□□ -0.168e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-230ENST00000561266 671 ntTSL 313.99□□□□□ -0.175e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.188e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 USP20-205ENST00000474895 825 ntTSL 513.9□□□□□ -0.188e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.191e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.198e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 GNAS-236ENST00000479025 466 ntTSL 213.81□□□□□ -0.29e-15■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-211ENST00000460655 572 ntTSL 413.71□□□□□ -0.218e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 PLCD1-203ENST00000461445 3271 ntTSL 213.7□□□□□ -0.228e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.228e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.248e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.248e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 USP20-207ENST00000491731 821 ntTSL 213.52□□□□□ -0.258e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CREBZF-202ENST00000490820 4329 ntTSL 1 (best)13.5□□□□□ -0.258e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-220ENST00000583329 998 ntTSL 313.43□□□□□ -0.268e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.268e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.288e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.288e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TAF1D-201ENST00000323981 2540 ntTSL 213.16□□□□□ -0.38e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-213ENST00000467096 942 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.318e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.328e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MAP7D1-206ENST00000462118 776 ntTSL 312.92□□□□□ -0.348e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STRN4-223ENST00000602223 554 ntTSL 412.92□□□□□ -0.341e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AUP1-208ENST00000486234 984 ntTSL 512.87□□□□□ -0.358e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.351e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.358e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-219ENST00000496003 815 ntTSL 512.84□□□□□ -0.358e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TPM1-215ENST00000558868 653 ntTSL 212.84□□□□□ -0.355e-9■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.378e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SRPK2-204ENST00000462282 505 ntTSL 312.72□□□□□ -0.378e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.388e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CASC4-205ENST00000558735 427 ntTSL 312.68□□□□□ -0.388e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NPRL3-210ENST00000610509 2917 ntTSL 212.68□□□□□ -0.388e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.398e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.48e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPS9-212ENST00000495002 956 ntTSL 1 (best)12.52□□□□□ -0.411e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.418e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.418e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 STX16-220ENST00000496117 528 ntTSL 512.46□□□□□ -0.418e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MPP1-210ENST00000462825 587 ntTSL 412.42□□□□□ -0.428e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 BNIP3L-203ENST00000520077 922 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.451e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 HSPD1-205ENST00000428204 549 ntTSL 412.17□□□□□ -0.461e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SAP30BP-214ENST00000580601 2786 ntTSL 211.96□□□□□ -0.498e-6■□□□□ 8.1
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 154.2 ms