Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms