Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LYVE1Q9Y5Y7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYVE1Q9Y5Y7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYVE1Q9Y5Y7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms