Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX4Q9Y2E6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DTX4Q9Y2E6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DTX4Q9Y2E6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DTX4Q9Y2E6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms