Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HPSEQ9Y251 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HPSEQ9Y251 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPSEQ9Y251 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms