Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
BRPF3Q9ULD4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRPF3Q9ULD4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
BRPF3Q9ULD4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRPF3Q9ULD4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRPF3Q9ULD4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRPF3Q9ULD4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRPF3Q9ULD4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRPF3Q9ULD4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRPF3Q9ULD4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRPF3Q9ULD4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRPF3Q9ULD4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRPF3Q9ULD4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms